La Fundación se constituye con la participación de Patronos y Colaboradores. Ambas figuras vienen definidas en los estatutos de la fundación. Los patronos son los que tienen un mayor grado de implicación, ya que constituyen el patronato que es el órgano de gobierno y representación de la Fundación. Estos se convierten en actores responsables de la ejecución de las políticas públicas que han de corresponsabilizarse con el Principal en el diseño de la prestación de los servicios públicos descentralizados.      

El patronato de la Fundación, se halla constituido por representantes del Gobierno de Cantabria y de instituciones y empresas vinculadas con las actividades que desarrolla la Fundación CTL-Cantabria en el ámbito de sus áreas estratégicas de trabajo.